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Strategies and utility of imputed SNP genotypes for genomic analysis in dairy cattle

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>We investigated strategies and factors affecting accuracy of imputing genotypes from lower-density SNP panels (Illumina 3K, 7K, Affymetrix 15K and 25K, and evenly spaced subsets) up to one medium (Illumina 50K) and one high-density (Illumina 800K) SNP panel. We a...

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Principais autores: Khatkar Mehar S, Moser Gerhard, Hayes Ben J, Raadsma Herman W
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BMC 2012-10-01
coleção:BMC Genomics
Assuntos:
Imputation
800K
High-density SNP
Dairy cattle
Genomic selection
Acesso em linha:http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/538
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