strainedSMILES2xyz: a workflow for reliable 3D structures of strained molecules from SMILES

Abstract Accurate 3D structure generation from SMILES is essential for data-driven chemistry but often fails for strained ring systems. We introduce strainedSMILES2xyz, a Python workflow that improves conformer generation by relaxing RDKit constraints, exploring stereoisomer variants, and correcting...

وصف كامل

التفاصيل البيبلوغرافية

المؤلفون الرئيسيون:	Tori Demuth, Julian Schnizer, Dennis Svatunek
التنسيق:	Artigo
اللغة:	Inglês
منشور في:	BMC 2026-05-01
سلاسل:	Journal of Cheminformatics
الموضوعات:	Ring strain Conformer generation RDKit Bioorthogonal chemistry Cycloalkynes trans-Cycloalkenes
الوصول للمادة أونلاين:	https://doi.org/10.1186/s13321-026-01219-0
الوسوم:	إضافة وسم لا توجد وسوم, كن أول من يضع وسما على هذه التسجيلة!