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TOP1 CAD-seq: A protocol to map catalytically engaged topoisomerase 1 in human cells

Summary: TOP1 CAD-seq enables mapping of TOP1 sites of covalent engagement with DNA. The procedure depends upon enrichment of DNA-covalent adducts using chaotropic salts and immunoprecipitation with an antibody specific for TOP1. Here, we describe a step-by-step protocol compatible with Illumina seq...

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Principais autores: Vladislav Kuzin, Anika Wiegard, Donald P. Cameron, Laura Baranello
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Elsevier 2022-09-01
coleção:STAR Protocols
Assuntos:
Bioinformatics
Cancer
Sequencing
ChIPseq
Molecular Biology
Antibody
Acesso em linha:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666166722004610
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