基于Illumina MiSeq的麋鹿粪样菌群多样性分析

为探究麋鹿（<italic>Elaphurus davidianus</italic>）肠道菌群的结构和组成，为麋鹿消化道疾病防治提供有价值的基础数据，应用Illumina MiSeq对4个麋鹿栖息地32只麋鹿粪便样本的16S rRNA的V3—V4可变区进行扩增，结合样本的OTU种类及丰度，用R软件进行聚类和主成分分析（PCA），并计算多样性指数。结果表明：共获得1 438 677条有效序列，平均每个样品有（44 959±12 153）条有效序列；将序列拼接优化，在97%相似度条件下获得31 459个物种分类的OTUs，平均每个样品为（983±240）个OTUs；平均读长为426 bp。对测序...

詳細記述

書誌詳細

主要な著者:	李俊芳, 白冰, 孟庆辉, 程志斌, 单云芳, 刘田, 钟震宇
フォーマット:	Artigo
言語:	Chinês
出版事項:	Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2023-02-01
シリーズ:	野生动物学报
主題:	麋鹿 肠道菌群 Illumina MiSeq测序 粪便
オンライン･アクセス:	http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20230111
タグ:	タグ追加 タグなし, このレコードへの初めてのタグを付けませんか!