Flankophile: a bioinformatic pipeline for prokaryotic genomic synteny analysis

ABSTRACT Analysis of flanking region sequences can be useful when comparing mobile prokaryotic sequences from different bacterial isolates or metagenomes. Here, we report a new bioinformatics tool, a pipeline called Flankophile, which can analyze flanking regions and sequence variants. The main feat...

Szczegółowa specyfikacja

Opis bibliograficzny

Główni autorzy:	Alix Vincent Thorn, Frank M. Aarestrup, Patrick Munk
Format:	Artigo
Język:	Inglês
Wydane:	American Society for Microbiology 2024-01-01
Seria:	Microbiology Spectrum
Hasła przedmiotowe:	bioinformatics antibiotics resistance veterinary microbiology software phylogenetic analysis epidemiology
Dostęp online:	https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02413-23
Etykiety:	Dodaj etykietę Nie ma etykietki, Dołącz pierwszą etykiete!