HiFiAdapterFilt, a memory efficient read processing pipeline, prevents occurrence of adapter sequence in PacBio HiFi reads and their negative impacts on genome assembly

Abstract Background Pacific Biosciences HiFi read technology is currently the industry standard for high accuracy long-read sequencing that has been widely adopted by large sequencing and assembly initiatives for generation of de novo assemblies in non-model organisms. Though adapter contamination f...

Mô tả đầy đủ

Chi tiết về thư mục

Những tác giả chính:	Sheina B. Sim, Renee L. Corpuz, Tyler J. Simmonds, Scott M. Geib
Định dạng:	Artigo
Ngôn ngữ:	Inglês
Được phát hành:	BMC 2022-02-01
Loạt:	BMC Genomics
Những chủ đề:	PacBio HiFi Circular consensus sequencing Adapter Sequence data filtering
Truy cập trực tuyến:	https://doi.org/10.1186/s12864-022-08375-1
Các nhãn:	Thêm thẻ Không có thẻ, Là người đầu tiên thẻ bản ghi này!