Investigating the impact of database choice on the accuracy of metagenomic read classification for the rumen microbiome

Abstract Microbiome analysis is quickly moving towards high-throughput methods such as metagenomic sequencing. Accurate taxonomic classification of metagenomic data relies on reference sequence databases, and their associated taxonomy. However, for understudied environments such as the rumen microbi...

Szczegółowa specyfikacja

Opis bibliograficzny

Główni autorzy:	Rebecca H. Smith, Laura Glendinning, Alan W. Walker, Mick Watson
Format:	Artigo
Język:	Inglês
Wydane:	BMC 2022-11-01
Seria:	Animal Microbiome
Hasła przedmiotowe:	Metagenome-assembled genomes Metagenome Rumen Microbiome Reference databases Read classification
Dostęp online:	https://doi.org/10.1186/s42523-022-00207-7
Etykiety:	Dodaj etykietę Nie ma etykietki, Dołącz pierwszą etykiete!