RINQ: Reference-based Indexing for Network Queries

par Gülsoy, Günhan, Kahveci, Tamer
Publié 2011

Signal reachability facilitates characterization of probabilistic signaling networks

par Gabr, Haitham, Kahveci, Tamer
Publié dans BMC Bioinformatics (2015)

Identification of large disjoint motifs in biological networks

par Elhesha, Rasha, Kahveci, Tamer
Publié dans BMC Bioinformatics (2016)

Indexing a protein-protein interaction network expedites network alignment

par Hasan, Md Mahmudul, Kahveci, Tamer
Publié dans BMC Bioinformatics (2015)

Classification and feature selection algorithms for multi-class CGH data

par Liu, Jun, Ranka, Sanjay, Kahveci, Tamer
Publié 2008

Scalable Steady State Analysis of Boolean Biological Regulatory Networks

par Ay, Ferhat, Xu, Fei, Kahveci, Tamer
Publié 2009

SubMAP: Aligning Metabolic Pathways with Subnetwork Mappings

par Ay, Ferhat, Kellis, Manolis, Kahveci, Tamer
Publié 2011

Metabolic network alignment in large scale by network compression

par Ay, Ferhat, Dang, Michael, Kahveci, Tamer
Publié 2012

HIDEN: Hierarchical decomposition of regulatory networks

par Gülsoy, Günhan, Bandhyopadhyay, Nirmalya, Kahveci, Tamer
Publié 2012

Network-based Prediction of Cancer under Genetic Storm

par Ay, Ahmet, Gong, Dihong, Kahveci, Tamer
Publié 2014

Hierarchical decomposition of dynamically evolving regulatory networks

par Ay, Ahmet, Gong, Dihong, Kahveci, Tamer
Publié dans BMC Bioinformatics (2015)

ProMotE: an efficient algorithm for counting independent motifs in uncertain network topologies

par Ren, Yuanfang, Sarkar, Aisharjya, Kahveci, Tamer
Publié dans BMC Bioinformatics (2018)

Shortest path counting in probabilistic biological networks

par Ren, Yuanfang, Ay, Ahmet, Kahveci, Tamer
Publié dans BMC Bioinformatics (2018)

Prediction of host-pathogen protein interactions by extended network model

par KÖSESOY, İrfan, GÖK, Murat, KAHVECİ, Tamer
Publié dans Turk J Biol (2021)

A scalable method for identifying frequent subtrees in sets of large phylogenetic trees

par Ramu, Avinash, Kahveci, Tamer, Burleigh, J Gordon
Publié 2012

A scalable method for discovering significant subnetworks

par Hasan, Md Mahmudul, Kavurucu, Yusuf, Kahveci, Tamer
Publié 2013

Selected research articles from the 2016 International Workshop on Computational Network Biology: Modeling, Analysis, and Control (CNB-MAC)

par Yoon, Byung-Jun, Qian, Xiaoning, Kahveci, Tamer
Publié dans BMC Bioinformatics (2017)

CMRF: analyzing differential gene regulation in two group perturbation experiments

par Bandyopadhyay, Nirmalya, Somaiya, Manas, Ranka, Sanjay, Kahveci, Tamer
Publié 2012

Large scale analysis of signal reachability

par Todor, Andrei, Gabr, Haitham, Dobra, Alin, Kahveci, Tamer
Publié 2014

Integrating Domain Specific Knowledge and Network Analysis to Predict Drug Sensitivity of Cancer Cell Lines

par Kim, Sebo, Sundaresan, Varsha, Zhou, Lei, Kahveci, Tamer
Publié dans PLoS One (2016)