Barcode identification for single cell genomics

Abstract Background Single-cell sequencing experiments use short DNA barcode ‘tags’ to identify reads that originate from the same cell. In order to recover single-cell information from such experiments, reads must be grouped based on their barcode tag, a crucial processing step that precedes other...

תיאור מלא

שמור ב:
מידע ביבליוגרפי
Main Authors: Akshay Tambe, Lior Pachter
פורמט: Artigo
שפה:Inglês
יצא לאור: BMC 2019-01-01
סדרה:BMC Bioinformatics
נושאים:
Single-cell
Barcodes
Barcode identification
de Bruijn graph
Circularization
K-mer counting
גישה מקוונת:http://link.springer.com/article/10.1186/s12859-019-2612-0
תגים: הוספת תג
אין תגיות, היה/י הראשונ/ה לתייג את הרשומה!

פריטים דומים