অনুসন্ধান ফলাফলগুলি - Joshua M Stuart

Accurate cancer phenotype prediction with AKLIMATE, a stacked kernel learner integrating multimodal genomic data and pathway knowledge. অনুযায়ী Vladislav Uzunangelov, Christopher K Wong, Joshua M Stuart

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Computational integration of homolog and pathway gene module expression reveals general stemness signatures. অনুযায়ী Martina Koeva, E Camilla Forsberg, Joshua M Stuart

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Associating transcription factors to single-cell trajectories with DREAMIT অনুযায়ী Nathan D. Maulding, Lucas Seninge, Joshua M. Stuart

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Biological process activity transformation of single cell gene expression for cross-species alignment অনুযায়ী Hongxu Ding, Andrew Blair, Ying Yang, Joshua M. Stuart

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Dual RNA-Seq analysis of SARS-CoV-2 correlates specific human transcriptional response pathways directly to viral expression অনুযায়ী Nathan D. Maulding, Spencer Seiler, Alexander Pearson, Nicholas Kreusser, Joshua M. Stuart

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Pathway-Based Genomics Prediction using Generalized Elastic Net. অনুযায়ী Artem Sokolov, Daniel E Carlin, Evan O Paull, Robert Baertsch, Joshua M Stuart

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

The manatee variational autoencoder model for predicting gene expression alterations caused by transcription factor perturbations অনুযায়ী Ying Yang, Lucas Seninge, Ziyuan Wang, Anthony Oro, Joshua M. Stuart, Hongxu Ding

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Transformer-based modeling of Clonal Selection and Expression Dynamics reveals resistance mechanisms in breast cancer অনুযায়ী Nathan D Maulding, Jun Zou, Wei Zhou, Ciara Metcalfe, Joshua M Stuart, Xin Ye, Marc Hafner

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Prioritizing transcriptional factors in gene regulatory networks with PageRank অনুযায়ী Hongxu Ding, Ying Yang, Yuanqing Xue, Lucas Seninge, Henry Gong, Rojin Safavi, Andrea Califano, Joshua M. Stuart

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

RADIA: RNA and DNA integrated analysis for somatic mutation detection. অনুযায়ী Amie J Radenbaugh, Singer Ma, Adam Ewing, Joshua M Stuart, Eric A Collisson, Jingchun Zhu, David Haussler

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

A factor graph nested effects model to identify networks from genetic perturbations. অনুযায়ী Charles J Vaske, Carrie House, Truong Luu, Bryan Frank, Chen-Hsiang Yeang, Norman H Lee, Joshua M Stuart

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Molecular signatures of quiescent, mobilized and leukemia-initiating hematopoietic stem cells. অনুযায়ী E Camilla Forsberg, Emmanuelle Passegué, Susan S Prohaska, Amy J Wagers, Martina Koeva, Joshua M Stuart, Irving L Weissman

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Revealing cancer subtypes with higher-order correlations applied to imaging and omics data অনুযায়ী Kiley Graim, Tiffany Ting Liu, Achal S. Achrol, Evan O. Paull, Yulia Newton, Steven D. Chang, Griffith R. Harsh, Sergio P. Cordero, Daniel L. Rubin, Joshua M. Stuart

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Common and cell-type specific responses to anti-cancer drugs revealed by high throughput transcript profiling অনুযায়ী Mario Niepel, Marc Hafner, Qiaonan Duan, Zichen Wang, Evan O. Paull, Mirra Chung, Xiaodong Lu, Joshua M. Stuart, Todd R. Golub, Aravind Subramanian, Avi Ma’ayan, Peter K. Sorger

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Germline contamination and leakage in whole genome somatic single nucleotide variant detection অনুযায়ী Dorota H. Sendorek, Cristian Caloian, Kyle Ellrott, J. Christopher Bare, Takafumi N. Yamaguchi, Adam D. Ewing, Kathleen E. Houlahan, Thea C. Norman, Adam A. Margolin, Joshua M. Stuart, Paul C. Boutros

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Reproducible biomedical benchmarking in the cloud: lessons from crowd-sourced data challenges অনুযায়ী Kyle Ellrott, Alex Buchanan, Allison Creason, Michael Mason, Thomas Schaffter, Bruce Hoff, James Eddy, John M. Chilton, Thomas Yu, Joshua M. Stuart, Julio Saez-Rodriguez, Gustavo Stolovitzky, Paul C. Boutros, Justin Guinney

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Identifying Aspects of the Post-Transcriptional Program Governing the Proteome of the Green Alga Micromonas pusilla. অনুযায়ী Peter H Waltman, Jian Guo, Emily Nahas Reistetter, Samuel Purvine, Charles K Ansong, Marijke J van Baren, Chee-Hong Wong, Chia-Lin Wei, Richard D Smith, Stephen J Callister, Joshua M Stuart, Alexandra Z Worden

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Valection: design optimization for validation and verification studies অনুযায়ী Christopher I Cooper, Delia Yao, Dorota H Sendorek, Takafumi N Yamaguchi, Christine P’ng, Kathleen E Houlahan, Cristian Caloian, Michael Fraser, SMC-DNA Challenge Participants, Kyle Ellrott, Adam A Margolin, Robert G Bristow, Joshua M Stuart, Paul C Boutros

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Combining accurate tumor genome simulation with crowdsourcing to benchmark somatic structural variant detection অনুযায়ী Anna Y. Lee, Adam D. Ewing, Kyle Ellrott, Yin Hu, Kathleen E. Houlahan, J. Christopher Bare, Shadrielle Melijah G. Espiritu, Vincent Huang, Kristen Dang, Zechen Chong, Cristian Caloian, Takafumi N. Yamaguchi, ICGC-TCGA DREAM Somatic Mutation Calling Challenge Participants, Michael R. Kellen, Ken Chen, Thea C. Norman, Stephen H. Friend, Justin Guinney, Gustavo Stolovitzky, David Haussler, Adam A. Margolin, Joshua M. Stuart, Paul C. Boutros

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য

Author Correction: Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes অনুযায়ী Matthew A. Reyna, David Haan, Marta Paczkowska, Lieven P. C. Verbeke, Miguel Vazquez, Abdullah Kahraman, Sergio Pulido-Tamayo, Jonathan Barenboim, Lina Wadi, Priyanka Dhingra, Raunak Shrestha, Gad Getz, Michael S. Lawrence, Jakob Skou Pedersen, Mark A. Rubin, David A. Wheeler, Søren Brunak, Jose M. G. Izarzugaza, Ekta Khurana, Kathleen Marchal, Christian von Mering, S. Cenk Sahinalp, Alfonso Valencia, PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group, Jüri Reimand, Joshua M. Stuart, Benjamin J. Raphael, PCAWG Consortium

সম্পূর্ণ পাঠ পাওয়ার জন্য